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根據臨床統計，絕大多數發生結石的部位是腎臟，稱為「腎結石」，如結石跟著泌尿系統開始往下走，到輸尿管就稱為「輸尿管結石」，到膀胱就是「膀胱結石」。由此可以知道，當結石較小時，是有機會隨著尿液一起排出體外，甚至不需接受治療就可痊癒。
書田診所泌尿科主任醫師周固表示，結石能不能自行排出的關鍵，主要是在其大小與位置，若結石在0.5公分以下，呈細長形且表面不滑，就比較容易被排出；但如果結石大於0.5公分左右，且呈不規則形狀，就很可能會卡在輸尿管而引發一系列的症狀。早期對於結石的治療，主要是靠藥物、點滴及要求患者大量飲水，藉此讓結石自然排出。這樣的治療對於患者來說，無疑是種冒險與痛苦，假使結石體積較大而療程較長時，患者必須忍受結石帶來的絞痛、尿路阻塞等狀況，還可能因此造成腎功能損傷，而若不考慮藥物治療，就唯有手術開刀一途。
需手術治療的狀況
不過，現今在體外震波碎石機與泌尿道內視鏡的長足發展下，以徹底改變結石患者治療的途徑，約70%的患者，可用體外震波碎石機擊碎結石，25%患者則可以內視鏡治療，僅有5%的病患，才需用傳統開刀來取出石頭。
周固指出，患者因為絞痛、血尿等狀況來求診時，醫師會先以影像檢查來確定結石的位置與大小。臨床觀察上由於多數患者的石頭較偏小，治療上會建議患者每天喝水超過3000c.c.，排尿量維持在2000c.c.以上，有9成的患者可藉由排尿順便將石頭排放出去。不過若有以下情形，醫師就會考慮以手術治療的方式處理：
1 結石造成尿路阻塞，並出現腎臟水腫，影響腎功能。
2 合併持續性的尿路阻塞。
3 合併嚴重的血尿。
4 腎絞痛而藥物治療無效。
5 石頭大於0.8公分，且呈不規則狀。
消除結石治療法
結石的體積並不是決定治療方式的唯一要素，同時還要看位置、成分及併發症，再安排最合適的治療。
體外震波碎石術
◎治療方式：利用3D定位，以電震波經過水與身體的傳導，對結石產生壓力後，造成結石崩解成細小碎粒。小碎石最後會隨著尿液排出體外。
◎治療建議：腎臟結石小於2公分、阻塞不嚴重或腎臟積水狀況輕微的輸尿管結石等，是使用體外震波碎石術的理想患者。但若腎臟出口已阻塞、結石大於2公分、鹿角狀結石等的患者，使用效果則不佳。懷孕婦女禁止使用。
內視鏡→經皮腎截石術
◎治療方式：先在腰部放入一根引流管，在X光或超音波定位下，利用內視鏡順著管子進到腎臟結石所在處後，再選擇使用雷射碎石機、超音波碎石機、水震波碎石機等儀器，將石頭擊碎，或用夾子、碎石鉗取出石頭。
◎治療建議：
1 腎結石大於2公分的患者，應先使用經皮腎截石術，將大石頭擊碎後取出，若仍有殘留的小石頭，再輔以體外震波碎石機，合併治療。
2 上段輸尿管結石者，利用經皮腎截石術，將內視鏡經過皮膚到輸尿管治療。
3 膀胱結石的石頭通常較大、較圓，建議使用經皮腎截石術方式，以水震波碎石等儀器將石頭擊碎。
內視鏡→輸尿管鏡碎石術
◎治療方式：將輸尿管鏡進到結石處後，以氣動式、雷射或超音波等各類碎石機來擊碎石頭。
◎治療建議：中段或下段輸尿管結石者因腎臟阻塞嚴重，可考慮使用。
內視鏡→尿道鏡碎石術
◎治療方式：尿道結石通常是由腎臟、輸尿管、膀胱的結石掉下來卡住的石頭，將尿道鏡深入狹窄的尿道後直接取出石頭，或用碎石機擊碎石頭。
◎治療建議：因常合併有其他疾病發生，應同時治療其他疾病，以確實改善結石問題。
手術治療
◎治療方式：外科手術將腎盂或腎臟切開後，取出石頭。
◎治療建議：石頭大於2.5公分或鹿角結石且使用其他方式都無效時，才以手術處理。
避免復發的飲食原則
尿路結石的復發率相當高，若患者治療後沒有做好預防工作，根據臨床統計，10年內的復發機率有5成以上。書田診所營養師林容安表示，結石的生成除了因遺傳或疾病造成之外，個人生活習慣與飲食，還是占了多數原因。
因此，若想要預防結石發生或是避免復發，改善生活與飲食是必需的。
1 水分充足：
每天攝取超過2000c.c.的液體（至少1000c.c.要來自於白開水），是預防尿路結石的基礎，也是重要的一項。林容安指出，水分能稀釋尿液中的溶質，避免高濃度的尿酸、草酸、胱胺酸等物質，因為飽和而結晶，演變為結石。另外，當有結晶形成時，若有充足的尿液，也可以沖洗掉任何形式的結晶，預防結石產生。炎熱夏天或運動過後的排汗量大，建議至少要再額外補充300~500c.c.水分。
2 維持適量的排尿：
每天排尿量應該保持在2000c.c.左右，約1~2小時就要去上一次廁所。
3 減少動物性蛋白質攝取：
動物性蛋白質在體內代謝的過程中，會使尿液中鈣離子及尿酸增加，並減少檸檬酸的濃度，增進結石的發生。臨床研究中發現男性結石的患者大於女性的其中一個原因，就是肉或海鮮吃得比較多，建議每天肉類的攝取量控制在一個手掌內的量，減少結石危險因子。
4 適量鈣質攝取：
《美國泌尿科醫學會會刊》指出，鈣質攝取不足的飲食，會增加鈣結石形成的機會，確保飲食中有適量的鈣質，反而有預防效果。這是因為食物中的鈣質過低時，會使小腸吸收草酸量上升，造成尿液中草酸濃度上升，只要草酸濃度過高，就容易形成草酸鈣結晶，而累積成結石。林容安建議一天2~3杯240c.c.的牛奶或優酪乳，就足夠一天所需的鈣質含量。
5 減少高草酸含量食物的攝取：
在台灣絕大多數的結石患者屬於「草酸鈣結石」，因此，菠菜、甘藍類蔬菜、芹菜、草莓、葡萄、核桃、花生、巧克力、可樂等食物，應適量減少比例。
6 避免高鹽飲食：
鈉會抑制腎小管對鈣的再吸收，因此，必須限制鈉鹽的攝取量，包括火腿、香腸、泡菜等加工醃漬類都屬於高鹽食物，應盡量避免，鹽巴每天攝取量應維持在1茶匙以下。
7 增加檸檬酸鹽含量：
哈佛大學公衛系統計，葷食者罹患結石的比率比素食者多出三分之一，原因可能是素食者經常食用的高鉀食物，讓尿液中的檸檬酸鹽含量增加，降低結石發生率。建議多吃富含檸檬酸鹽的檸檬、黑醋栗、蔓越莓等水果，或是鉀含量高的胡蘿蔔、芹菜、大番茄、莧菜、柳丁、哈密瓜、木瓜。
8 留意維生素Ｃ補充劑量：
過量（ > 2,000毫克）的維生素C，會促使草酸增加，因此，每天維生素C的補充不要超過2000毫克（2公克）。
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